Просыпаюсь уставшим. Что делать?

Первоначально обратитесь к терапевту. Пройдите анализы: общий крови, мочи, биохимический.
Порекомендовала бы также сдать гормоны щитовидной железы: ТТГ, свободный Т3 и свободный Т4.

А может вы действительно просто устали? Спать по 6 с половиной часов в сутки вовсе не полезно. А если учесть, что вы пишите, что ложитесь около полуночи, и это совсем не значит, что вы тут же засыпаете, то остается чистых около 6 часов. Ваши слова о здоровом образе жизни скорее всего подразумевают под собой активный образ жизни. А это значит, что существуют дополнительные "средства накопления утомления". Кроме того, при всех плюсах активного образа жизни, он не идет на пользу, если не доставляет удовольствия или соблюдается чересчур рьяно. Когда здоровый образ жизни становится такой же "рутиной", как и работа-дом, вы начинаете чувствовать себя вечно уставшим. Плюс, возвращаясь к началу своей тирады, недостаточное количество сна. В общем, мое мнение (повторюсь) - вы действительно устали. Вам бы на необитаемый остров... Без будильников...

А не кушаете на ночь? Я на себе проводил опыт - не ел после шести вечера и в 10-00 ложился, через две недели такого истязания - высыпался как слон! Правда я на это время отказывался от кофе чая и других напитков кроме воды.